Id-daqs tal-kavità ta 'ċiklodestrinmolekuli jistgħu jaqblu mal-molekuli mistiedna, u l-gruppi hydroxyl fit-truf tal-kavità jistgħu jiffurmaw bonds idroġenu mal-molekuli mistieden. In-natura idrofobika ta 'ġewwa tippermettilha li tinkapsula molekuli lipofiliċi. Konsegwentement, jippossjedi l-abbiltà li jagħraf u jinteraġixxi b'mod selettiv ma 'molekuli organiċi. Ġie applikat b'suċċess f'diversi metodi kromatografiċi u elettroforetiċi biex jiġu separati diversi isomeri u enantiomeri.
Ħafna mediċini jew il-prekursuri tagħhom għandhom mill-inqas ċentru kirali wieħed, u ħafna drabi enantiomer wieħed ikun attiv filwaqt li l-ieħor huwa inattiv jew saħansitra tossiku. L-użu ta 'cyclodextrin jew cyclodextrin polimeri jtejjeb it-teknoloġija ta' separazzjoni ta 'enantiomers, speċjalment ma' cyclodextrin modifikat bil-molekula chiral. Per eżempju, Tang Kuowen et al. utilizzati-cyclodextrinpolimeru bħala l-fażi stazzjonarja, polydimethylsiloxane bħala d-dilwent, u kromatografija tal-gass biex tissepara isomeri pożizzjonali u isomeri kirali ta 'serje ta' komposti aromatiċi. Riżultati sperimentali jindikaw li dan iċ-ċiklodextrin juri kapaċità qawwija ta 'rikonoxximent chiral, partikolarment juri kapaċitajiet ta' separazzjoni sinifikanti għal enantiomers ta 'alkenes, ketoni, esteri, eċċ.
